Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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PCLAFQ15004 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PCLAFQ15004 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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