Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HDAC1Q13547 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HDAC1Q13547 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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