Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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FOXF1Q12946 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXF1Q12946 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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FOXF1Q12946 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FOXF1Q12946 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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