Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RBBP4Q09028 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms