Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
C4orf47A7E2U8 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
C4orf47A7E2U8 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms