Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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HOXD1Q9GZZ0 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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HOXD1Q9GZZ0 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HOXD1Q9GZZ0 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HOXD1Q9GZZ0 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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