Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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ZNF239Q16600 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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ZNF239Q16600 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ZNF239Q16600 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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