Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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