Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATMQ13315 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATMQ13315 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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ATMQ13315 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.5
ATMQ13315 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
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ATMQ13315 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATMQ13315 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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