Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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