Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GDAP2Q9NXN4 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms