Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RBM39Q14498 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RBM39Q14498 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RBM39Q14498 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RBM39Q14498 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms