Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HSPB3Q12988 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms