Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC96Q2M329 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms