Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ITGB3BPQ13352 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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