Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PTPRGP23470 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRGP23470 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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