Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
C9orf135Q5VTT2 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
C9orf135Q5VTT2 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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