Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KNOP1Q1ED39 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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