Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DDX39BQ13838 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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