Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RUNX3Q13761 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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