Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NME3Q13232 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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NME3Q13232 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NME3Q13232 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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