Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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