Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMEM225BP0DP42 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms