Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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SYCP1Q15431 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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SYCP1Q15431 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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SYCP1Q15431 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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SYCP1Q15431 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SYCP1Q15431 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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