Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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