Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SQLEQ14534 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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