Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
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