Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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TRAF1Q13077 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TRAF1Q13077 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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