Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMPOP42166 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TMPOP42166 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TMPOP42166 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMPOP42166 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms