Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRCP08575 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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