Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ACACAQ13085 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms