Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
EHD3Q9NZN3 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
EHD3Q9NZN3 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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