Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HOXD1Q9GZZ0 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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