Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNS3Q9BQ31 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNS3Q9BQ31 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms