Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IMPG1Q17R60 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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