Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RPE65Q16518 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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