Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQLEQ14534 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SQLEQ14534 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQLEQ14534 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SQLEQ14534 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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