Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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ITGB3BPQ13352 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGB3BPQ13352 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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