Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPFP49454 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CENPFP49454 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CENPFP49454 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms