Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm5538W4VSP6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5538W4VSP6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms