Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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