Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Crlf3Q9Z2L7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms