Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Robo3Q9Z2I4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms