Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms