Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mbd3Q9Z2D8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mbd3Q9Z2D8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms