Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mbd4Q9Z2D7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms