Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cldn6Q9Z262 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn6Q9Z262 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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