Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ilf3Q9Z1X4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms