Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3b1Q9Z1T1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms