Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx39bQ9Z1N5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms